企業項目管理體系建設的核心是建立企業的項目管理方法，目前,大部分組織缺乏系統的、統一的項目管理方法。在我們咨詢的幾家公司中，我們常常會聽到這樣的質疑聲：一套方法怎么可以管所有的項目嗎？特別是IT項目，技術過程都不統一，如何用一套方法來管所有的項目，由此我們也看到很多樸素的管理方法在各個項目組織中自由成長，但在一個企業內，項目間的聯系是不可避免的，相互間的協作、配合由于缺少系統的管理方法，往往顧此失彼，矛盾此起彼伏，項目經理和公司領導成為消防隊員，責權不明，協調不暢, 常常陷于項目經理無法，公司管理層無奈，項目成員無所適從的狀態，給項目成功實施帶來了潛在的風險。是什么原因導致這樣的問題呢，是否有可行的辦法來解決這個問題呢？
一個完善的項目管理體系建設是與企業本身的行業背景、業務領域是分不開的，出現上面的問題的根本原因就在于項目管理和業務流程的交叉，導致項目管理過程復雜化，不可控，這也就是為什么大家說一套方法不可以適用所有的項目的根本原因。
企業的項目運作包括業務流程、項目管理、技術工作三個方面，業務流程是如何運作業務，是由企業的行業特點、業務背景所決定，項目管理是如何管理項目，而技術工作則是實現項目目標所需要的技術手段。對于一個企業而言，建立企業的項目管理方法論就需要依照企業的業務流程、技術手段來設計相應的管理方法。
項目管理方法是一個結構化的方法，是可以在大部分項目中應用的方法，具體實踐過程中，項目管理方法需要針對行業特點，建立適合行業特色的項目管理體系。
依照項目管理理論，項目管理過程按階段劃分為啟動、計劃、實施、收尾，對于任何一個項目我們都可以依此進行階段的劃分，這是項目的共性，而對于項目中的個性就是項目的業務和技術層面，對于具體的企業，項目階段劃分就需要由業務流程和技術方法決定，在實施過程中，針對具體的項目進行客戶化，項目管理方法論的核心就是綜合所有項目的特點，建立一套包括技術、工具、管理技巧在內的一站式服務的指南和模板。這種將項目管理方法和業務流程相互配合，并在實踐中進行優化的管理方法，就是項目管理方法論。
項目管理體方法論的重要表現形式是項目管理手冊，這是組織規范項目標準管理過程的重要手段，通過正確的決策、高效的流程、標準的操作、可控的過程，確保項目的有效實施。
企業項目管理手冊編制的基本方法可分為三個層面，一是項目管理理論知識體系，目前世界范圍內比較通用的主流項目管理知識體系，包括美國項目管理協會（PMI）推出的《項目管理知識體系指南PMBOK》，英國商務部開發的項目管理方法《PRINCE2成功的項目管理》可作為理論支撐。二是在管理方法上跨國企業實施項目的管理方法，中國著名企業的項目管理經驗可作為最佳實踐基礎，在此基礎上則是對企業本身項目管理實踐經驗的總結。從三個層面對企業的項目管理過程進行梳理、定義、借鑒，即可固化出企業本身的項目管理方法。
具體到項目管理手冊內容就是描述項目輸入轉變為輸出的過程。通過項目階段過程的定義，將項目管理過程、項目實施支撐、項目監控方法及項目作業指導，系統化地與項目管理理論及產品要求融入到具體的操作實踐過程中。具體包括以下主要內容：
1. 項目過程控制階段劃分：通常需要考慮兩類過程，一是按照項目的管理過程，對項目過程進行階段劃分；另外是按照項目的技術過程，將項目過程進行階段劃分。企業的業務流程，主要關注項目的管理階段劃分，而項目經理執行和管理項目時，必須將項目的管理階段和項目的技術階段劃分結合起來，進行項目管理。
2. 階段輸入和輸出：包括數據和信息、計劃和報告、風險及可以交付的成果等；
3. 過程控制：包括工作流程，工作方法、操作規則和作業指導；
4. 角色職責：在實踐中，項目管理職責，不能簡單歸于項目經理一個人，而是由一組角色共同完成，包括職能部門和角色對項目階段和實施步驟的貢獻。
依照項目管理方法論編制的項目管理手冊，將項目實施過程中的項目管理方法與企業的業務流程、技術方法有機地集成起來，從而建立以項目管理為核心的業務流程。