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    化合物相似性,有時候也會說分子相似性,是指兩個分子或者化合物在結構上的相似程度,而相似化合物一般在化學反應上的效果類似,以及在生物活性(biological activity)上面也會有同樣的作用。
    在計算化合物相似性的過程中,使用的是分子指紋(molecular fingerprint)來進行比較。比較兩個化合物分子指紋時,最常用的是杰卡德系數(Tanimoto(or Jaccard) coefficient )T來度量其相似程度。若兩個化學結構的指紋的T>0.85,一般就視為相似的。
    以相似性為基礎可以進行虛擬篩選(virtual screening),是一種ligand-based的虛擬篩選,為了要在上百萬中化合物數據庫中進行高效的相似性篩選,通過使用指紋比對效率最為高效。
    posted on 2011-06-30 14:13 周銳 閱讀(2703) 評論(1)  編輯  收藏 所屬分類: Chemistry
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