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    <label id="bn8ez"><meter id="bn8ez"></meter></label>

    weidagang2046的專欄

    物格而后知致
    隨筆 - 8, 文章 - 409, 評論 - 101, 引用 - 0
    數據加載中……

    用grep函數提取文件中符合規則的行

    提取以ID(共4字符,首字符為數字,其余三個字符為數字或字母),chain或region開始的行:

    1i95
    complexed with ede, mg, wo2, zn
    chain q [62030]  
    1e7z
    contains C-terminal His tag
    complexed with hg
    chain a [25318]  
    1khi  
    region a:103-173 [77409]  
    1fgu  
    the N-terminal two domains free
    region a:181-298 [25296]  
    region a:299-426 [25297]  
    region b:181-289 [25298]  
    region b:298-426 [25299]  
    1hnz  
    complexed with hyg, mg, zn
    chain q [25354]  
    1gd7  
    chain a [60441]  
    chain b [60442]  
    chain c [60443]  
    chain d [60444]

    $file = $ARGV[0];

    open(FH, $file|| die "Can not open $file: $!\n";

    @lines = <FH>;

    @extract = grep(/(^\d\w{3}$)|(^(chain|region))/, @lines);

    print @extract;

    posted on 2006-03-09 09:19 weidagang2046 閱讀(914) 評論(0)  編輯  收藏 所屬分類: Perl

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